生物工程系成立于2010年，現有生物學、醫學、藥學、植物學、心理學等專業教師18人，其中碩士學位教師13人，院級學科帶頭人1人，骨干教師1人，擁有一支重視學科交叉，重視基礎與應用結合，學術水平較高、治學嚴謹、思想活躍的年輕學術隊伍。近年來承擔省部級科研項目2項，并多次在全國、省市及學院組織的教科研活動中取得優異成績。

生物工程系設有生物制藥、發酵技術、化妝品制造與營銷3個專業。其中生物制藥專業為本系特色專業。現有在校生600余人，另有300余人在企業實習。近年來向社會輸送了大量的優秀畢業生，這些畢業生受到用人單位的一致好評。

建系以來，本著以適應社會為宗旨，以就業為導向的人才培養目標，堅持產學研相結合，注重培養學生實踐創新能力。積極響應國家及學院要求，逐步推進“工學結合一體化教學”改革，探索校企合作新模式，與多家企業建立了長期穩定的合作關系，為學生實習就業奠定了可靠的基礎。